25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4817 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4817  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  463  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4368  hypothetical protein  81.17 
 
 
239 aa  384  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01020  hypothetical protein  33 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.551056  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2657  hypothetical protein  36.56 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00775221  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4367  hypothetical protein  34.65 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4816  hypothetical protein  32.46 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.536398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0175  hypothetical protein  30.42 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0933557  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0086  hypothetical protein  30.04 
 
 
252 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1144  hypothetical protein  28.5 
 
 
262 aa  62  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437754  normal  0.0600359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5416  hypothetical protein  29.6 
 
 
273 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5035  hypothetical protein  29.6 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5123  hypothetical protein  29.6 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5663  hypothetical protein  28.76 
 
 
266 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570228  normal  0.031893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3405  hypothetical protein  30.04 
 
 
247 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5476  hypothetical protein  34.36 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0174  hypothetical protein  36.48 
 
 
263 aa  55.8  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0142  hypothetical protein  29.75 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13873  hypothetical protein  27.27 
 
 
258 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5737  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.02 
 
 
270 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4935  hypothetical protein  26.6 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5502  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.63 
 
 
266 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5211  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.63 
 
 
266 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5122  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  32.63 
 
 
266 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_54952  predicted protein  30.25 
 
 
415 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1085  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.25 
 
 
276 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.429706  normal  0.50341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>