21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13873 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13873  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  510  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5663  hypothetical protein  63.5 
 
 
266 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570228  normal  0.031893 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5123  hypothetical protein  62.31 
 
 
273 aa  317  9e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5035  hypothetical protein  62.31 
 
 
273 aa  317  9e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5416  hypothetical protein  62.93 
 
 
273 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1144  hypothetical protein  62.06 
 
 
262 aa  297  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437754  normal  0.0600359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0174  hypothetical protein  42.86 
 
 
263 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0142  hypothetical protein  37.35 
 
 
245 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0086  hypothetical protein  38.8 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01020  hypothetical protein  34.47 
 
 
265 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.551056  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5476  hypothetical protein  30.89 
 
 
254 aa  85.1  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2657  hypothetical protein  31.98 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00775221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0175  hypothetical protein  30.27 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0933557  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1109  hypothetical protein  28.3 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182239  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4816  hypothetical protein  35.65 
 
 
304 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.536398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4368  hypothetical protein  30.26 
 
 
239 aa  58.5  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4367  hypothetical protein  32.41 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3402  hypothetical protein  26.92 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  0.301913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4817  hypothetical protein  27.27 
 
 
239 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3405  hypothetical protein  27.46 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4935  hypothetical protein  26.9 
 
 
245 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>