16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_R0035 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_R0035  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0048  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0031  tRNA-Leu  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.372245 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3069    94.12 
 
 		 627 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1218  hypothetical protein  94.12 
 
 		 501 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0649  hypothetical protein  94.12 
 
 		 627 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0504    94.12 
 
 		 435 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000696773  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0062  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.185406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0876  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.322681  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0043  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0054  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000429153  normal  0.0864889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t58  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334218  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0051  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.815889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0072  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828257  normal  0.1525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0048  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>