13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0856 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0856  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  413  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1367  hypothetical protein  47.8 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1262  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.6 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1076  hypothetical protein  25.1 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1134  hypothetical protein  24.8 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.61666  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1072  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.27 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1270  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.53 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1123  xylose isomerase domain-containing protein  27.06 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0449759  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2481  hypothetical protein  25.21 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1499  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.36 
 
 		 272 aa  48.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1679  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  23.17 
 
 		 271 aa  45.1  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.917084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2597  xylose isomerase domain-containing protein  39.71 
 
 		 270 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3496  hypothetical protein  33.78 
 
 		 264 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>