16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0789 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0789  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07240  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  32.14 
 
 
269 aa  132  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01402  exopolysaccharide xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  40.77 
 
 
264 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1094  GumL  32.5 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1100  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  31.43 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26470  ExoV-like protein  31.91 
 
 
268 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4932  hypothetical protein  34.27 
 
 
625 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2755  exoV domain-containing protein  28.7 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47160  predicted protein  27.62 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000445115  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2361  exoV domain-containing protein  30.95 
 
 
266 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4937  hypothetical protein  30.26 
 
 
696 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07265  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  25.32 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2966  ExoV-like protein  25.87 
 
 
296 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0575869  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4804  ExoV-like protein  26.17 
 
 
333 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5933  succinoglycan biosynthesis protein  29.33 
 
 
321 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0650  ketal pyruvate transferase protein  28.57 
 
 
299 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>