16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0149 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0149  putative integral membrane protein  100 
 
 
190 aa  371  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.359577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0502  hypothetical protein  60 
 
 
191 aa  216  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2102  DoxX family protein  59.89 
 
 
197 aa  207  8e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0132413  normal  0.296398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2245  DoxX family protein  65.19 
 
 
188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0747562  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6943  DoxX family protein  58.06 
 
 
201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1903  DoxX family protein  56.82 
 
 
184 aa  194  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.244663  normal  0.193783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3436  DoxX family protein  57.3 
 
 
182 aa  194  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3657  DoxX family protein  59.06 
 
 
184 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10640  DoxX protein  57.49 
 
 
186 aa  180  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0732523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3522  hypothetical protein  55.93 
 
 
182 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4739  DoxX family protein  51.18 
 
 
191 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3810  DoxX family protein  51.96 
 
 
182 aa  165  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0189  DoxX family protein  53.5 
 
 
177 aa  158  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2516  DoxX family protein  46.43 
 
 
185 aa  157  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0257788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3582  DoxX family protein  45.88 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8099  putative integral membrane protein  31.43 
 
 
119 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>