28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4601 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4601  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  610  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711496  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2624  beta-lactamase domain protein  67.82 
 
 
290 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00220053  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3174  beta-lactamase domain protein  69.55 
 
 
290 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0646  Beta-lactamase-like  67.94 
 
 
298 aa  431  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4155  beta-lactamase domain-containing protein  66.9 
 
 
299 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2145  beta-lactamase domain protein  63.67 
 
 
289 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.518031  normal  0.715051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2101  beta-lactamase domain protein  63.67 
 
 
289 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4330  beta-lactamase domain-containing protein  44.49 
 
 
293 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14831  Zn-dependent hydrolase  38.36 
 
 
304 aa  225  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.861965  normal  0.085675 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45054  predicted protein  26.24 
 
 
429 aa  73.6  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.597228  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0088  hypothetical protein  22.37 
 
 
240 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.45541  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3439  Beta-lactamase-like  24.46 
 
 
228 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.254177  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5132  beta-lactamase domain protein  24.74 
 
 
227 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3896  beta-lactamase-like  23.33 
 
 
207 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.560821  normal  0.310182 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3494  putative ferredoxin  39.73 
 
 
78 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.317772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0739  putative ferredoxin  40 
 
 
77 aa  59.3  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1922  putative ferredoxin  36.99 
 
 
77 aa  55.8  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.871908  decreased coverage  0.000431531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2876  putative ferredoxin  39.73 
 
 
80 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.730811  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1051  hypothetical protein  27.56 
 
 
187 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0539048 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2017  hypothetical protein  42.86 
 
 
86 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2648  beta-lactamase domain protein  32.23 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1706  beta-lactamase domain-containing protein  22.39 
 
 
257 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.702666  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2813  beta-lactamase-like protein  26.28 
 
 
226 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3287  hypothetical protein  26.28 
 
 
226 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0422328  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2323  putative ferredoxin  35.62 
 
 
76 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4004  beta-lactamase-like protein  22.73 
 
 
246 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0417617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1978  hypothetical protein  29.17 
 
 
218 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.628499  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1870  beta-lactamase domain-containing protein  23.84 
 
 
205 aa  42  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>