19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3950 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3950  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 140 aa  283  7e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174143  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4782  TPR repeat-containing protein  59.71 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0204  TPR repeat-containing protein  55.4 
 
 		 140 aa  174  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2909  TPR repeat-containing protein  51.09 
 
 		 139 aa  161  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0910  hypothetical protein  48.57 
 
 		 142 aa  157  7e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.328003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0411  TPR repeat-containing protein  50.72 
 
 		 141 aa  149  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0422  hypothetical protein  50.72 
 
 		 141 aa  149  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1288  TPR repeat-containing protein  47.83 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.806395 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0333  hypothetical protein  40.88 
 
 		 139 aa  121  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01911  hypothetical protein  41.61 
 
 		 139 aa  120  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.775534 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26241  hypothetical protein  40.15 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.49947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1486  hypothetical protein  41.61 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.952228  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2358  hypothetical protein  38.41 
 
 		 140 aa  115  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01331  hypothetical protein  39.42 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0474344  normal  0.486944 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01351  hypothetical protein  39.39 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01341  hypothetical protein  39.39 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.442457  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0120  hypothetical protein  39.39 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01311  hypothetical protein  37.98 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 395 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>