23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0979 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0979  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  437  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0600583  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4526  protein of unknown function DUF1001  54.5 
 
 
200 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.390851  normal  0.829315 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5722  protein of unknown function DUF1001  49.23 
 
 
204 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0440  CpeT-like  46.52 
 
 
204 aa  176  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.637972 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1887  CpeT-like  43.3 
 
 
204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0944089  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22311  CpeT  41.15 
 
 
204 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2579  hypothetical protein  37.97 
 
 
199 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.755501  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0272  protein of unknown function DUF1001  36.9 
 
 
196 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03371  hypothetical protein  36.22 
 
 
192 aa  134  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2275  hypothetical protein  36.9 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0800  hypothetical protein  36.08 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5043  hypothetical protein  34.22 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.968769  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3679  protein of unknown function DUF1001  34.22 
 
 
195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1676  CpeT protein  32.26 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0329357  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03901  CpeT  31.72 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0448364  normal  0.0403253 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1417  protein of unknown function DUF1001  33.69 
 
 
196 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.83474  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1383  protein of unknown function DUF1001  33.69 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0419  hypothetical protein  27.72 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0631886  normal  0.0277692 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1910  hypothetical protein  27.32 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4579  hypothetical protein  26.26 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5176  protein of unknown function DUF1001  25.6 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046678 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0772  hypothetical protein  22.34 
 
 
197 aa  48.9  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.101942  normal  0.37279 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2712  hypothetical protein  20.47 
 
 
354 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.334178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>