25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0164 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0164  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  100 
 
 		 180 aa  370  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.731985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0834  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  65.62 
 
 		 199 aa  224  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.369195  normal  0.0462432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0096  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  55.8 
 
 		 181 aa  222  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1129  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  56.28 
 
 		 183 aa  208  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3575  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  53.55 
 
 		 183 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2531  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  53.55 
 
 		 183 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2604  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  51.09 
 
 		 183 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0132832  normal  0.179303 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09721  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  48.5 
 
 		 204 aa  164  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1640  putative photosystem II oxygen-evolving complex 23K protein PsbP  48 
 
 		 193 aa  158  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11891  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  43.26 
 
 		 194 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1400  putative photosystem II oxygen-evolving complex 23K protein PsbP  46.24 
 
 		 192 aa  155  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.21037  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12051  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  42.13 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.493042  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12041  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  41.57 
 
 		 185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1109  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  41.24 
 
 		 185 aa  150  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20885  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10881  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  42.68 
 
 		 186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.327352 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0650  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  41.71 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0415879  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14821  photosystem II oxygen evolving complex protein PsbP  42.29 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.400899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1038  photosystem II oxygen-evolving complex 23K protein  33.87 
 
 		 195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.723321 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_118778  lumenal PsbP-like protein  34.76 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.130954  normal  0.114626 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48359  predicted protein  30.82 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_48109  oxygen evolving enhancer 2 of Photosystem II  31.29 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.124849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_89292  lumenal PsbP-like protein  27.14 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.015352  normal  0.019871 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44991  lumenal PsbP-like protein  31.34 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.67705  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49743  predicted protein  36.8 
 
 		 428 aa  51.2  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.733154  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119587  thylakoid lumenal 20 kDa protein, putative  23.67 
 
 		 285 aa  42.4  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.667191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>