14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3056 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3056  hypothetical protein  100 
 
 
579 aa  1103    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000386731  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2144  hypothetical protein  36.52 
 
 
414 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00533951  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0869  LasA protease precursor  36.52 
 
 
424 aa  157  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0779  LasA protease precursor  36.52 
 
 
424 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.113695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2357  Peptidase M23  34.83 
 
 
402 aa  156  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2358  Peptidase M23  35.27 
 
 
323 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1834  LasA protease precursor  37.78 
 
 
414 aa  140  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.341416  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3100  Peptidase M23  32.3 
 
 
954 aa  110  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0055  Peptidase M23  33.33 
 
 
355 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.738429  decreased coverage  0.00000593211 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5290  peptidase M23B  31.84 
 
 
554 aa  88.2  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3417  LasA protease precursor  28.12 
 
 
418 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.38875  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40290  LasA protease precursor  28.34 
 
 
418 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0437567  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1284  M24/M37 family peptidase  32.35 
 
 
435 aa  44.7  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.276116  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  36.59 
 
 
353 aa  44.3  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>