More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_R0027 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_R0027  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192215  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0029  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000677739  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3080t  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  141  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000741594  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna056  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113642  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2541  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000144493  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2331  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0242  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0015965  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna027  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0681284  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3190t  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  141  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0404538  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3086t  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  141  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00276275  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna014  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000133223  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna075  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000135974  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06831  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1119t  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  141  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.009413  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna030  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000601005  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna087  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000826788  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2337  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  141  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559971  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00377  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00252  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01011  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00466  tRNA-Glu  100 
 
 		 73 bp  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0007  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866877  hitchhiker  0.000537745 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0086  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138064  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0016  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000647027  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0035  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000448273  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0036  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000110474  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0034  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00458122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0066  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0228326  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0102  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0002  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0220588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0037  tRNA-Glu  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000193498  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0037  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000713649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0036  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000056115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0002  tRNA-Glu  97.18 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0165934  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00064  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0611511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00073  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.101192  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0028  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000151808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0089  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0392203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0112  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000205577  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0028  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0423864  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0048  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0107  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0341166  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0067  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000550936  normal  0.0102746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0008  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.029159  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0038  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0232145  normal  0.168988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0087  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00145961  normal  0.0492727 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5055  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0897941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4721  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00309501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0043  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888454 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5097  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000188223  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0023  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.834038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4233  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000331616  normal  0.0574538 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t20  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t22  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t30  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t32  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA37  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.244013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA39  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783995  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0112  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010822  hitchhiker  0.00272786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R64  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R66  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5082  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0023409  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0048  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0601001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0041  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0885225 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2744  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0202899  normal  0.795242 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0030  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11215  normal  0.168988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0030  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.044277  normal  0.615022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0052  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.514953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0050  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.652046 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0032  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0707402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0030  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3056  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0721496  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4502  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00140691  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4327  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000475323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0034  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.103972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2873  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.174339  normal  0.2866 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4911  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00060997  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3665  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0302552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0034  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402265  normal  0.166571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0036  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0430019  normal  0.171485 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0104  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.597387  normal  0.0687014 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0032  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.041206  normal  0.167752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2336  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0131684  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4707  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4686  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0982037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4716  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000625265  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0088  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00276432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0090  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00102507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0092  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000105241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0094  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000925295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0095  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000290046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0096  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0097  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000012419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5105  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0706149  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0050  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0032  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000829453  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0129  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00335623  normal  0.0126805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4416  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000380054  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4125  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00109058  normal  0.113801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0025  tRNA-Glu  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.797735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>