More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_R0034 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_R0027  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.692909  normal  0.166571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0030  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11215  normal  0.168988 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0029  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.370228  normal  0.16961 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0032  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.041206  normal  0.167752 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0034  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0402265  normal  0.166571 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0036  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0430019  normal  0.171485 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0038  tRNA-Glu  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0232145  normal  0.168988 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0040  tRNA-Glu  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000578854  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0038  tRNA-Glu  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000438841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0047  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000519759  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0045  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000152021  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0044  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000161143  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0042  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260023  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0095  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000187463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0097  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00001173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0098  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00699861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0099  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0236458  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0100  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0345698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0101  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0318597  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0105  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000352091  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0106  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000169546  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0107  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000079121  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0108  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000317177  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0109  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000956258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0110  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000963161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0043  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364581  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0046  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000603782  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0041  tRNA-Glu  98.59 
 
 
76 bp  133  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000984885  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0037  tRNA-Glu  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000193498  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0036  tRNA-Glu  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000110474  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0035  tRNA-Glu  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000448273  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0034  tRNA-Glu  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00458122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0086  tRNA-Glu  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.138064  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0016  tRNA-Glu  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000647027  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0042  tRNA-Glu  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779226  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0044  tRNA-Glu  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000878437  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0002  tRNA-Glu  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0220588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0102  tRNA-Glu  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0066  tRNA-Glu  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0228326  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00045  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0997281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00064  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0611511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00073  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.101192  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00078  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00645399  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0028  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000151808  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0089  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0392203  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0097  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.442636  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0112  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000205577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0067  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000550936  normal  0.0102746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0008  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.029159  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3699  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0040697  normal  0.0437365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3593  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0242982  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0107  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0341166  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4117  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0976755  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5105  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0706149  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0087  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00145961  normal  0.0492727 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4911  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00060997  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4458  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0692997  hitchhiker  0.00363105 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4173  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00665107  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3665  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0302552  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4389  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0118319  normal  0.7898 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4223  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0747628  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3830  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00526178  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3762  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00180196  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0112  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010822  hitchhiker  0.00272786 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0027  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192215  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0029  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000677739  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2874  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.403763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4686  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0982037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4707  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3591  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000586916  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2769  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00441704  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4423  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000172052  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2987  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4282  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0611024  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4586  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000616309  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5193  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411185  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5055  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0897941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4721  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00309501  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5082  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0023409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0104  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.597387  normal  0.0687014 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0032  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000829453  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2744  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0202899  normal  0.795242 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4125  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00109058  normal  0.113801 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4327  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000475323  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3056  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0721496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4416  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000380054  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4502  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00140691  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4233  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000331616  normal  0.0574538 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0088  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00276432  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0090  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00102507  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0092  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000105241  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0094  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000925295  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0095  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000290046  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0096  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000128006  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0097  tRNA-Glu  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000012419  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2873  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.174339  normal  0.2866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4512  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00641389  normal  0.576073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2853  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0537203  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4510  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0115463  normal  0.0174598 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4102  tRNA-Glu  94.74 
 
 
78 bp  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116386  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>