17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0692 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0692  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  397  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3394  hypothetical protein  32.31 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1371  hypothetical protein  38.71 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1304  tail assembly chaperone gp38  35.79 
 
 
146 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230331  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2346  hypothetical protein  36.96 
 
 
159 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  34.38 
 
 
145 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  34.38 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1299  hypothetical protein  46.38 
 
 
66 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1632  hypothetical protein  32.46 
 
 
209 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.915049  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1786  hypothetical protein  32.46 
 
 
209 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.256091  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  33.33 
 
 
142 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  36.56 
 
 
140 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2471  tail fiber assembly protein  35.37 
 
 
121 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  42.86 
 
 
139 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00846  conserved hypothetical protein  29.67 
 
 
145 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00852  hypothetical protein  29.67 
 
 
145 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1306  hypothetical protein  32.53 
 
 
152 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000530633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>