54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0504 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0504  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  450  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4028  signal peptide protein  43.22 
 
 		 208 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4292  signal peptide protein  41.88 
 
 		 187 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4180  putative signal peptide protein  41.88 
 
 		 187 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0328239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0549  hypothetical protein  34.16 
 
 		 181 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0565  hypothetical protein  34.16 
 
 		 181 aa  88.6  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0732  hypothetical protein  34.16 
 
 		 189 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203793  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0106  hypothetical protein  34.16 
 
 		 181 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2911  hypothetical protein  34.16 
 
 		 181 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1482  hypothetical protein  34.16 
 
 		 181 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.553331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3136  hypothetical protein  34.16 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396711  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0457  hypothetical protein  34.97 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4145  hypothetical protein  34.93 
 
 		 187 aa  85.5  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_003296  RS03145  signal peptide protein  39.32 
 
 		 187 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.561242 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0487  hypothetical protein  37.39 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6144  hypothetical protein  35.82 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0571  hypothetical protein  36.59 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.514247  hitchhiker  0.00795396 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2874  hypothetical protein  36.52 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2732  hypothetical protein  36.52 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2200  hypothetical protein  37.39 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.185923  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2814  hypothetical protein  37.39 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2825  hypothetical protein  37.39 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0302  hypothetical protein  29.83 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0346  hypothetical protein  31.71 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22064  hitchhiker  0.000122714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0778  hypothetical protein  31.3 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1324  hypothetical protein  29.85 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.232671  normal  0.60591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4452  hypothetical protein  29.45 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0993  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.262375  normal  0.178793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0737  hypothetical protein  27.92 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0849  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.0957945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0765  hypothetical protein  30.53 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1064  hypothetical protein  26.67 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0203  putative signal peptide protein  34.78 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.613077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0953  hypothetical protein  28.68 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01920  lipidA 3-O-deacylase  25.49 
 
 		 177 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4744  hypothetical protein  28.17 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.179642  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5636  hypothetical protein  27.94 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0023  hypothetical protein  34.43 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5310  Lipid A 3-O-deacylase  24.2 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2560  hypothetical protein  25.9 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3154  hypothetical protein  25.18 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0288324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61650  Lipid A 3-O-deacylase  23.57 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0713933 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0006  hypothetical protein  33.06 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2892  hypothetical protein  24.46 
 
 		 173 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2700  hypothetical protein  24.81 
 
 		 173 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0024  hypothetical protein  33.06 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0022  hypothetical protein  31.16 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00035  hypothetical protein  29.17 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0010  hypothetical protein  30.77 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3809  hypothetical protein  35.11 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3668  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000166039  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0942  hypothetical protein  30.25 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0424238  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5424  hypothetical protein  36.17 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1159  hypothetical protein  27.97 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>