13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0015 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0015  MltA-interacting MipA  100 
 
 		 279 aa  578  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046334  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1330  putative outer membrane protein  31.97 
 
 		 277 aa  142  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.428976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2761  putative outer membrane protein  31.94 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4195  putative outer membrane protein  31.32 
 
 		 282 aa  132  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0996091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0909  MltA-interacting MipA family protein  31.4 
 
 		 304 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2703  putative outer membrane protein  29.1 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4756  putative outer membrane protein  25 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  23.81 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  24.74 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  29.57 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  37.35 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1171  MltA-interacting MipA  22.13 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.731654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  38.89 
 
 		 497 aa  42.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>