67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2131 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2131  putative dissimilatory sulfite reductase  100 
 
 		 110 aa  229  7.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1632  DsrC-like protein  35.23 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0635  DsrC-like protein  37.65 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218073  normal  0.311208 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2190  DsrC family protein  34.09 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3197  DsrC family protein  34.09 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0077  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  30.69 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595568 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0035  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  28.41 
 
 		 105 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0261  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  29.47 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1739  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  30.68 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.606399 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2658  DsrC -like protein  35.79 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1917  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  31.82 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.512017  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2958  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  30.68 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4045  DsrC family protein  27.27 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000373929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3037  DsrC family protein  36.05 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0059771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2561  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  36.05 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000243297  hitchhiker  0.0080986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0853  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  30.23 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000299223  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1042  sulfur transfer protein TusE  33.68 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.435905  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1147  sulfur transfer protein TusE  33.68 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1159  sulfur transfer protein TusE  33.68 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.240389  normal  0.524036 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1193  sulfur transfer protein TusE  33.68 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1125  sulfur transfer protein TusE  33.68 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.84282e-21 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1922  DsrC-like protein  36.46 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.692492  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0856  DsrC family protein  31.25 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1196  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  28.41 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270848 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0970  sulfite reductase, gamma subunit  30.93 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000838427  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0762  dissimilatory sulfite reductase, gamma subunit  28.41 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0463  DsrC family protein  28.41 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2847  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  29.47 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102705  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0534  DsrC family protein  27.27 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0351  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  33.72 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00980  hypothetical protein  31.58 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00973  predicted sulfite reductase subunit  31.58 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0364521  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1471  sulfur oxidation protein of DsrC family protein  27.08 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0048  DsrC family protein  27.37 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000243579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2018  DsrC family protein  30.93 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000134118  hitchhiker  0.000725923 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1956  DsrC family protein  30.53 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1536  DsrC family protein  31.11 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1481  sulfur transfer protein TusE  30.53 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0185238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2538  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  28.42 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.023632  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2181  DsrC family protein  30 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350522  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2674  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  30.53 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000927643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1133  sulfur transfer protein TusE  30.53 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2347  sulfur transfer protein TusE  30.53 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2150  sulfur transfer protein TusE  30.53 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal  0.484844 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2627  sulfur transfer protein TusE  30.53 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0586166  hitchhiker  0.0000185004 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1083  sulfur transfer protein TusE  30.53 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000029188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1077  sulfur transfer protein TusE  30.53 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00172149  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0365  DsrC -like protein  31.52 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1858  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  26.04 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000483369  normal  0.0744764 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2480  putative sulfite reductase  27.37 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.295846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0329  sulfite reductase-like protein  27.37 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000011498  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2132  DsrC family protein  27.84 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0500463  normal  0.0142953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3077  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  28.42 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.475265  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1442  DsrC family protein  28.26 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.486208 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003411  tRNA 2-thiouridine synthesizing protein E  27.84 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1658  DsrC family protein  29.47 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1800  DsrC family protein  28.87 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0554138  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2529  sulfurtransferase TusE  28.42 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.248983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3211  sulfurtransferase TusE  30.53 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155098  hitchhiker  0.00231133 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2618  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  28.42 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02107  sulfite reductase, gamma subunit-related protein  27.84 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00973247  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1221  DsrC-like protein  28.16 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000524568  normal  0.0188943 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02366  hypothetical protein  26.8 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2687  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  26.32 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1522  DsrC family protein  32.65 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0907528  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1957  sulfite reductase, dissimilatory-type, gamma subunit  28.12 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000351468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2327  putative sulfite reductase  30.39 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.446517 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>