More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1546 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1546  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  876    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.128316  normal  0.0451663 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0715  hypothetical protein  47.2 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0153032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1832  hypothetical protein  51.96 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.973309  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1585  hypothetical protein  49.11 
 
 		 452 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.05334  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1642  hypothetical protein  49.33 
 
 		 452 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.565723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0875  hypothetical protein  50.11 
 
 		 454 aa  360  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02712  hypothetical protein  49.43 
 
 		 451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463858  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1256  Anthranilate synthase  49.77 
 
 		 443 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1921  Anthranilate synthase  46.52 
 
 		 487 aa  316  4e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.178229  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0977  p-aminobenzoate synthetase, component I  45.18 
 
 		 455 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000344028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0064  para-aminobenzoate synthase component I  41.71 
 
 		 465 aa  259  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1334  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  49.81 
 
 		 465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2108  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  43.43 
 
 		 466 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0064  anthranilate synthase  40.92 
 
 		 465 aa  249  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3258  anthranilate synthase component I-like protein  41.98 
 
 		 511 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0076  para-aminobenzoate synthase, component I  50.38 
 
 		 465 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1255  anthranilate synthase component I  41.27 
 
 		 500 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5240  para-aminobenzoate synthase, component I  41.14 
 
 		 465 aa  246  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0068  para-aminobenzoate synthase component I  40.58 
 
 		 465 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0064  para-aminobenzoate synthase component I  40.58 
 
 		 465 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0068  para-aminobenzoate synthase component I  40.58 
 
 		 465 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2351  chorismate binding-like protein  53.18 
 
 		 500 aa  245  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181309  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0064  para-aminobenzoate synthase component I  40.58 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3523  aminotransferase class IV  46.03 
 
 		 673 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.600789  hitchhiker  0.0000706242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1564  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.19 
 
 		 469 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0077  para-aminobenzoate synthase, component I  40.58 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000409192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0067  para-aminobenzoate synthase component I  49.81 
 
 		 480 aa  244  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2362  anthranilate synthase component I  41.46 
 
 		 495 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0080  para-aminobenzoate synthase, component I  49.81 
 
 		 465 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1122  anthranilate synthase, component I  47.16 
 
 		 496 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00596141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2866  anthranilate synthase component I-like protein  41.24 
 
 		 469 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3722  anthranilate synthase component I  41.98 
 
 		 491 aa  242  9e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803971 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.56 
 
 		 509 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  37.66 
 
 		 468 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1731  anthranilate synthase component I  42.77 
 
 		 491 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1776  anthranilate synthase  40.86 
 
 		 530 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2584  anthranilate synthase component I  41.42 
 
 		 495 aa  239  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003160  para-aminobenzoate synthase aminase component  37.98 
 
 		 453 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1230  anthranilate synthase component I-like protein  41.44 
 
 		 484 aa  239  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.693571  normal  0.438932 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04195  anthranilate synthase component I  40.1 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0730  anthranilate synthase, component I  48.3 
 
 		 494 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2369  anthranilate synthase component I  42.18 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4443  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.56 
 
 		 721 aa  237  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0921  para-aminobenzoate synthase, component I  35.32 
 
 		 458 aa  236  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0177158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2497  anthranilate synthase, component I  45.33 
 
 		 491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000612726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1003  anthranilate synthase, component I  48.54 
 
 		 517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.242829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2471  anthranilate synthase, component I  41.62 
 
 		 494 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3582  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.35 
 
 		 474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00051468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2877  anthranilate synthase component I  40.3 
 
 		 489 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  36.24 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0071  anthranilate synthase  42.25 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1546  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.79 
 
 		 466 aa  234  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4120  anthranilate synthase, component I  48.69 
 
 		 489 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3594  anthranilate synthase component I  46.62 
 
 		 503 aa  234  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2115  anthranilate synthase, component I  53.21 
 
 		 509 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.332687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41820  para-aminobenzoate synthase component I  40.82 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1804  anthranilate synthase component I  44 
 
 		 491 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0147265 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0983  anthranilate synthase component I  41.35 
 
 		 474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.371518  normal  0.264118 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4195  anthranilate synthase component I  38.82 
 
 		 504 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01914  para-aminobenzoate synthase, component I  39 
 
 		 456 aa  233  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0255  Para-aminobenzoate synthase, component I  40.16 
 
 		 471 aa  233  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3230  anthranilate synthase component I-like protein  40.37 
 
 		 469 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.359242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2120  anthranilate synthase component I  38.46 
 
 		 503 aa  232  8.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.016796 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1097  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.28 
 
 		 741 aa  232  9e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2239  anthranilate synthase  41.97 
 
 		 434 aa  232  9e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0498  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  45.68 
 
 		 642 aa  232  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2383  anthranilate synthase component I  46.79 
 
 		 491 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2603  anthranilate synthase  42.06 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0445726  normal  0.0808647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0156  anthranilate synthase component I  48.48 
 
 		 522 aa  230  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.970752  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4201  para-aminobenzoate synthase component I  40.96 
 
 		 462 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0880526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0690  Anthranilate synthase  35.73 
 
 		 465 aa  230  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4052  anthranilate synthase, component I  38.6 
 
 		 528 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502776  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17641  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  34.76 
 
 		 506 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2359  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.29 
 
 		 469 aa  230  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00205255  hitchhiker  0.000900079 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22721  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  47.41 
 
 		 506 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.267297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2228  anthranilate synthase, component I  41.15 
 
 		 521 aa  229  6e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3549  para-aminobenzoate synthase component I  40.38 
 
 		 408 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2082  anthranilate synthase component I  40.7 
 
 		 491 aa  229  8e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2250  anthranilate synthase component I  40.49 
 
 		 502 aa  229  9e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4721  anthranilate synthase, component I  46.24 
 
 		 504 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0266  anthranilate synthase component I  38.87 
 
 		 501 aa  229  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1785  anthranilate synthase  44.17 
 
 		 505 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20231  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  45.22 
 
 		 506 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0376  anthranilate synthase component I  47.73 
 
 		 493 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957074  normal  0.0417216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4188  para-aminobenzoate synthase component I  46.97 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0875  anthranilate synthase, component I  45.08 
 
 		 494 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000225677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0066  Anthranilate synthase  39.74 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1566  anthranilate synthase component I  36.58 
 
 		 498 aa  228  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0133412  hitchhiker  0.00994784 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0411  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  39.91 
 
 		 434 aa  228  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2413  anthranilate synthase component I  43.33 
 
 		 491 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4033  para-aminobenzoate synthase, subunit I  48.47 
 
 		 482 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151682  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1246  anthranilate synthase component I  45.08 
 
 		 492 aa  227  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0730  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.15 
 
 		 480 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000112385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0576  para-aminobenzoate synthase, component I  42.15 
 
 		 462 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1987  para-aminobenzoate synthase, subunit I  37.67 
 
 		 456 aa  227  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1978  para-aminobenzoate synthase, subunit I  35.8 
 
 		 474 aa  227  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.306568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4168  anthranilate synthase component I  37.93 
 
 		 505 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1869  anthranilate synthase component I  36.63 
 
 		 475 aa  227  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1569  anthranilate synthase  40.16 
 
 		 495 aa  226  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000157437  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1234  anthranilate synthase component I  46.33 
 
 		 504 aa  226  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0111358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>