25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0973 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0973  hypothetical protein  100 
 
 
485 aa  970    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.442051  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1763  hypothetical protein  50.31 
 
 
501 aa  462  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1514  hypothetical protein  50.11 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.721483  normal  0.922529 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2788  hypothetical protein  50.21 
 
 
484 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2733  hypothetical protein  42.74 
 
 
478 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0138  hypothetical protein  46.48 
 
 
469 aa  382  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000720067  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3318  hypothetical protein  44.66 
 
 
467 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1912  hypothetical protein  39.62 
 
 
484 aa  339  5.9999999999999996e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398652  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1929  hypothetical protein  33.18 
 
 
510 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.696713  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2711  hypothetical protein  35.97 
 
 
474 aa  263  6e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0676  hypothetical protein  36.75 
 
 
454 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2690  hypothetical protein  34.84 
 
 
498 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3680  hypothetical protein  33.05 
 
 
506 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2583  hypothetical protein  34.37 
 
 
463 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0198931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0011  hypothetical protein  27.82 
 
 
493 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0677  hypothetical protein  27.01 
 
 
524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.823751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2710  hypothetical protein  26.92 
 
 
519 aa  113  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1062  hypothetical protein  27.67 
 
 
460 aa  113  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2689  hypothetical protein  28.88 
 
 
506 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0471  hypothetical protein  23.91 
 
 
373 aa  85.9  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1372  hypothetical protein  27.86 
 
 
407 aa  57.4  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.856108  normal  0.0265653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  22 
 
 
552 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1148  hypothetical protein  27.59 
 
 
408 aa  50.4  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.159501 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1339  hypothetical protein  26.2 
 
 
432 aa  43.9  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  22.38 
 
 
551 aa  43.5  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>