39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0760 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0760  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  598  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0373973  normal  0.392235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0889  hypothetical protein  33 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3278  hypothetical protein  31.36 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3092  hypothetical protein  35.17 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1131  hypothetical protein  31.71 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0749  hypothetical protein  30.13 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.127849  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0381  MshA biogenesis protein MshI-1  30.33 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3336  hypothetical protein  38.57 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0450  biogenesis protein MshI  31.44 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3839  biogenesis protein MshI  28.38 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0504  biogenesis protein MshI  28.38 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0462  biogenesis protein MshI  28.51 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.572153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0501  biogenesis protein MshI  28.38 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0480  biogenesis protein MshI  28.38 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0540  biogenesis protein MshI  27.63 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3490  biogenesis protein MshI  28.11 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3667  biogenesis protein MshI  27.05 
 
 		 292 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0166  hypothetical protein  26.59 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927956  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4421  biogenesis protein MshI  29.2 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114.2  biogenesis protein MshI  25.76 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0332  fimbrial assembly family protein  28.51 
 
 		 553 aa  64.7  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.715461  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0385  biogenesis protein MshI  27.46 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0556  biogenesis protein MshI  27.71 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3351  biogenesis protein MshI  30.21 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3772  biogenesis protein MshI  27.65 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3755  biogenesis protein MshI  28.02 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00247  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshI (pilus type IV)  26.15 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0641  type IV pilus assembly protein PilM  22.31 
 
 		 352 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0971  Type IV pilus assembly protein PilM  21.49 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1546  type IV pilus assembly protein PilM  21.54 
 
 		 350 aa  46.2  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0675  type IV pilus assembly protein PilM  22.65 
 
 		 352 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0675  type IV pilus assembly protein PilM  22.04 
 
 		 352 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1810  type IV pilus assembly protein PilM  21.59 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2138  Tfp pilus assembly protein, ATPase PilM  23.35 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2669  type IV pilus assembly protein PilM  21.54 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000583624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0992  type IV pilus assembly protein PilM  20.75 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2817  MSHA biogenesis protein MshI  28.51 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1545  pilus-associated protein pilM  25.82 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.100373 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0686  type IV pilus assembly protein PilM  20.1 
 
 		 351 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>