26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0667 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0667  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  785    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0869947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1485  hypothetical protein  32.18 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.807311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10031  8-amino-7-oxononanoate synthase bioF2  28.35 
 
 		 771 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.863563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5530  hypothetical protein  26.32 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1027  hypothetical protein  23.21 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2458  hypothetical protein  25.82 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  24.32 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4655  hypothetical protein  24.87 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1036  hypothetical protein  24.24 
 
 		 407 aa  53.1  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.801484 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0804  hypothetical protein  25 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1863  hypothetical protein  17.89 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1140  hypothetical protein  18.73 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1114  protein of unknown function DUF482  25 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2734  hypothetical protein  25.96 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3315  hypothetical protein  24.84 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2802  hypothetical protein  23.29 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0294833  normal  0.670826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  23.43 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  23.64 
 
 		 374 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0657  hypothetical protein  21.89 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4876  hypothetical protein  23.42 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01036  hypothetical protein  22.53 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0479769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06130  hypothetical protein  22.53 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.187585  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2406  hypothetical protein  24.36 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688762  normal  0.186145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2450  hypothetical protein  23.26 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.456626  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  24.84 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3045  hypothetical protein  25.55 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.452075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>