14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2200 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2200  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  100 
 
 		 95 aa  201  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0615  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  64.58 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183857  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3027  hypothetical protein  65 
 
 		 84 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0458528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1547  bacterioferritin-associated ferredoxin  65 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0198  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  65 
 
 		 84 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4047  hypothetical protein  39.29 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3625  hypothetical protein  33.93 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3889  hypothetical protein  33.93 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0498268 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4276  hypothetical protein  32.14 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0564  hypothetical protein  30.36 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4213  hypothetical protein  32.14 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3020  hypothetical protein  32.14 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4121  putative bacterioferritin  35.71 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.286534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6243  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  45.83 
 
 		 92 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>