12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3020 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3020  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  214  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3889  hypothetical protein  80.58 
 
 		 103 aa  185  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0498268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4213  hypothetical protein  81.55 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4276  hypothetical protein  65.05 
 
 		 113 aa  150  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0564  hypothetical protein  64.08 
 
 		 103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3625  hypothetical protein  58.25 
 
 		 103 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4047  hypothetical protein  59.22 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0615  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  30.1 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183857  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1547  bacterioferritin-associated ferredoxin  37.5 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0198  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  37.5 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3027  hypothetical protein  37.5 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0458528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2200  putative bacterioferritin-associated ferredoxin  32.14 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>