82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1800 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1800  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
293 aa  593  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00968802  normal  0.0222473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5735  hypothetical protein  52.5 
 
 
290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162476  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5651  GCN5-related N-acetyltransferase  46.57 
 
 
288 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185637  normal  0.820471 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2115  hypothetical protein  44.09 
 
 
284 aa  251  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.336635  normal  0.573893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4269  GCN5-related N-acetyltransferase  48.21 
 
 
282 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7781  GCN5-related N-acetyltransferase  47.14 
 
 
285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.398474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1072  GCN5-related N-acetyltransferase  44.17 
 
 
284 aa  237  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0018213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7232  GCN5-related N-acetyltransferase  48.73 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4128  GCN5-related N-acetyltransferase  44.52 
 
 
293 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  43.66 
 
 
279 aa  230  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3914  GCN5-related N-acetyltransferase  44.13 
 
 
281 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2723  GCN5-related N-acetyltransferase  47.14 
 
 
281 aa  229  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.531068  normal  0.0776544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1481  GCN5-related N-acetyltransferase  46.07 
 
 
263 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.782256  normal  0.294011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24790  N-acetyltransferase  44.17 
 
 
284 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3091  GCN5-related N-acetyltransferase  43.66 
 
 
282 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885505  normal  0.0588943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4378  GCN5-related N-acetyltransferase  45.32 
 
 
263 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2270  GCN5-related N-acetyltransferase  44.09 
 
 
281 aa  223  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  42.96 
 
 
282 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884459 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0769  GCN5-related N-acetyltransferase  41.89 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0789619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1744  acetyltransferase  41.81 
 
 
282 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0310807  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1898  hypothetical protein  50.53 
 
 
277 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516328  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1390  hypothetical protein  38.87 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1606  hypothetical protein  38.52 
 
 
282 aa  216  4e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3343  acetyltransferase  37.28 
 
 
286 aa  212  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125163  hitchhiker  0.00516187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6203  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
290 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.551087  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1203  GCN5-related N-acetyltransferase  37.59 
 
 
280 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1232  GCN5-related N-acetyltransferase  37.94 
 
 
280 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3271  GCN5-related N-acetyltransferase  38.19 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5252  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
289 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406553 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2388  GCN5-related N-acetyltransferase  41.11 
 
 
280 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1230  hypothetical protein  36.14 
 
 
281 aa  186  5e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.157123  normal  0.0384423 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17571  GCN5-related N-acetyltransferase  36.15 
 
 
294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03651  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.159076  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03591  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08391  GCN5-related N-acetyltransferase  31.31 
 
 
295 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0559287  hitchhiker  0.00515939 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0207  GCN5-related N-acetyltransferase  31.31 
 
 
295 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.434013  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09611  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 
296 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402636 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03581  GCN5-related N-acetyltransferase  31.1 
 
 
296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0338  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.560109  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1816  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
293 aa  136  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3639  hypothetical protein  40.14 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.934549  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1561  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.82 
 
 
291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381847  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8960  GCN5-related N-acetyltransferase  33.83 
 
 
304 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0576  GCN5-related N-acetyltransferase  26.33 
 
 
301 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0543356 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1972  GCN5-related N-acetyltransferase  28.8 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0682  GCN5-related N-acetyltransferase  26.76 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.341989  normal  0.410017 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6068  GCN5-related N-acetyltransferase  28.18 
 
 
300 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6365  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1465  acetyltransferase  20.08 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1760  acetyltransferase, GNAT family  20.43 
 
 
286 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3079  GCN5-related N-acetyltransferase  26.75 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0448799 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1475  acetyltransferase  19.67 
 
 
286 aa  55.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1687  acetyltransferase, GNAT family  20.08 
 
 
283 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0785  putative acetyltransferase  35.35 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5516  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0715522  normal  0.230819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9240  acetyltransferase protein  29.31 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5669  hypothetical protein  29.15 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1655  acetyltransferase, GNAT family  20 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6566  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 
294 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225475 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5631  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 
292 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2798  acetyltransferase  25.7 
 
 
267 aa  52.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.097578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1619  acetyltransferase  18.83 
 
 
286 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1503  acetyltransferase  18.83 
 
 
286 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3690  acetyltransferase, GNAT family  19.5 
 
 
286 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1710  acetyltransferase  19.57 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100872  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6434  GCN5-related N-acetyltransferase  26.23 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6669  GCN5-related N-acetyltransferase  26.23 
 
 
300 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.097443  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0054  GCN5-related N-acetyltransferase  27.37 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.699783  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6093  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335222  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5597  GCN5-related N-acetyltransferase  24.29 
 
 
278 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835638 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1491  hypothetical protein  27.47 
 
 
290 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405441  hitchhiker  0.00239117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2937  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 
285 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4576  acetyltransferase  24.26 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4245  acetyltransferase  24.26 
 
 
277 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0591633  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2344  GCN5-related N-acetyltransferase  28.73 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4480  acetyltransferase, GNAT family  23.98 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4414  GCN5-related N-acetyltransferase  25.38 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1753  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 
152 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4428  acetyltransferase, GNAT family  23.76 
 
 
231 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4083  acetyltransferase  23.76 
 
 
277 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000292268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3464  GCN5-related N-acetyltransferase  23.78 
 
 
276 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5407  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 
144 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0501426  normal  0.511997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>