32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0793 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0793  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  275  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.716115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.48 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27470  hypothetical protein  56.74 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.73 
 
 		 213 aa  100  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.255062  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.59 
 
 		 213 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.59 
 
 		 213 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.94 
 
 		 213 aa  97.4  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.239441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0723  hypothetical protein  49.5 
 
 		 226 aa  95.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3487  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.28 
 
 		 217 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0801  integral membrane protein  52.78 
 
 		 207 aa  88.2  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.75 
 
 		 231 aa  86.3  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.494463  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2258  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.68 
 
 		 207 aa  85.1  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000178215  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1965  hypothetical protein  47.83 
 
 		 212 aa  84  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4504  hypothetical protein  48.91 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.4366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0042  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.47 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.122613  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1157  integral membrane protein  42.17 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1725  hypothetical protein  52.05 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142082  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3673  biopolymer transport protein-like protein  32.69 
 
 		 198 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1080  integral membrane protein  34.52 
 
 		 199 aa  70.5  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00417975  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0776  biopolymer transport protein-like protein  36.25 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1555  hypothetical protein  39.44 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.23 
 
 		 204 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2684  hypothetical protein  39.19 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288279  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2653  hypothetical protein  36.92 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39630  hypothetical protein  32.93 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.854792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3362  hypothetical protein  32.93 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00286668  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.85 
 
 		 208 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.18 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  28.57 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0539  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.36 
 
 		 222 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.36 
 
 		 216 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.333569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>