34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0115 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0115  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0287107  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0941  protein of unknown function DUF1007  25 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049615  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4544  hypothetical protein  24.31 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25009  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  27.1 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5736  protein of unknown function DUF1007  30.5 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  26.62 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1679  protein of unknown function DUF1007  25.9 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.355728  normal  0.476153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1399  protein of unknown function DUF1007  26.28 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0330358  normal  0.0597647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1352  hypothetical protein  24.36 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.361884 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3809  hypothetical protein  35.96 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2048  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.045391  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2246  hypothetical protein  23.57 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0285  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  29.67 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.396844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0859  hypothetical protein  21.74 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4269  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  23.76 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.655735 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4840  hypothetical protein  18.99 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3392  protein of unknown function DUF1007  25 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2760  protein of unknown function DUF1007  25.34 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3679  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  29.07 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.928215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3632  hypothetical protein  22.36 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0832359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2332  hypothetical protein  27.21 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0375324  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1975  putative lipoprotein  27.97 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2774  hypothetical protein  19.39 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2046  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  24.81 
 
 		 169 aa  43.9  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000946986  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3032  hypothetical protein  21.02 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.199492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1095  protein of unknown function DUF1007  22.5 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2906  hypothetical protein  23.61 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2975  protein of unknown function DUF1007  25.24 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0082  hypothetical protein  25.74 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.663458  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4248  hypothetical protein  27.27 
 
 		 231 aa  42.4  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0392  hypothetical protein  28.74 
 
 		 216 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0855106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1660  hypothetical protein  39.58 
 
 		 232 aa  42  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0619256  normal  0.666853 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1233  protein of unknown function DUF1007  23.73 
 
 		 202 aa  42  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1754  hypothetical protein  23.12 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>