21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2400 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2400  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  770    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000734126  hitchhiker  0.00220183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4381  hypothetical protein  57.4 
 
 		 391 aa  465  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2511  protein of unknown function DUF129  56.04 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1872  hypothetical protein  46.53 
 
 		 386 aa  331  1e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17421  hypothetical protein  43.94 
 
 		 388 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0781  hypothetical protein  45.29 
 
 		 381 aa  309  4e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.354225  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09681  hypothetical protein  39.57 
 
 		 384 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.200555  hitchhiker  0.00527786 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0201  hypothetical protein  39.34 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.142897  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08331  hypothetical protein  42.28 
 
 		 325 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.267137 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07881  hypothetical protein  32.94 
 
 		 388 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.85732  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08571  hypothetical protein  29.77 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08541  hypothetical protein  30.03 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0801  hypothetical protein  30.51 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0905  protein of unknown function DUF129  42.36 
 
 		 209 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0992  hypothetical protein  40.39 
 
 		 216 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000209758  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0887  hypothetical protein  37.2 
 
 		 215 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000149264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0487  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.54 
 
 		 236 aa  117  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000293437  normal  0.460106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1618  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.34 
 
 		 920 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.308528  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1632  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.33 
 
 		 926 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.740273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5966  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.97 
 
 		 893 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10450  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.24 
 
 		 938 aa  57.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00957139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>