18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1897 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1897  putative transcripton factor DevT-like  100 
 
 		 296 aa  607  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00338637  normal  0.506208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1990  metallophosphoesterase  50.87 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2908  metallophosphoesterase  49.13 
 
 		 300 aa  299  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4432  metallophosphoesterase  50 
 
 		 307 aa  281  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4496  metallophosphoesterase  50 
 
 		 307 aa  281  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4150  metallophosphoesterase  45.36 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.774048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0269  metallophosphoesterase  49.46 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00378904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3029  metallophosphoesterase  46.15 
 
 		 300 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.901725 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1455  putative transcripton factor  41.84 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1045  putative transcripton factor  41.26 
 
 		 262 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0714835  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07391  putative transcripton factor  37.33 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0113  putative transcripton factor  37.33 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.142539  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07941  putative transcripton factor  36.9 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0101021 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15621  putative transcripton factor  38.85 
 
 		 256 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.766626 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0679  putative transcripton factor  30.63 
 
 		 257 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07341  putative transcripton factor  30.4 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.348499  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07521  putative transcripton factor  33.33 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07321  putative transcripton factor  30.04 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>