15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0467 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0467  peptidase, metallopeptidase  100 
 
 
277 aa  556  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2544  peptidase metallopeptidase  33.6 
 
 
264 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2313  peptidase metallopeptidase  40.62 
 
 
268 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2262  peptidase metallopeptidase  40.62 
 
 
268 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0725  peptidase, metallopeptidase  36.84 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.364392  normal  0.750618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2212  hypothetical protein  39.44 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000676679 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1836  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  38.38 
 
 
234 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.764837  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4038  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00794485 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0907  peptidase, metallopeptidase  35 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.20081  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1002  hypothetical protein  33.7 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18281  hypothetical protein  50.85 
 
 
73 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1184  hypothetical protein  33.81 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1150  proteinase  30.43 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000104115  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3214  hypothetical protein  26.88 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.296344  normal  0.0548753 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0699  hypothetical protein  26.62 
 
 
229 aa  42  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.759494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>