21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0197 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0197  folate/biopterin transporter  100 
 
 
453 aa  878    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1237  biopterin transport-related protein BT1  64.38 
 
 
472 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122493  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4223  folate/biopterin transporter  67 
 
 
468 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0325732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0448  folate/biopterin transporter  64.01 
 
 
483 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5114  folate/biopterin transporter  60.99 
 
 
454 aa  521  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0603297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4368  folate/biopterin transporter  64.25 
 
 
441 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334747 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3211  folate/biopterin transporter  61.14 
 
 
458 aa  518  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4307  folate/biopterin transporter  64.02 
 
 
441 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21970  predicted protein  47.91 
 
 
495 aa  382  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00490278  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12682  FBT family transporter: folate/pteridine  47.32 
 
 
429 aa  372  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.415206  normal  0.304325 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49534  predicted protein  27.69 
 
 
610 aa  130  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47802  predicted protein  27.23 
 
 
600 aa  124  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1767  biopterin transporter  23.62 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35682  FBT family transporter: folate/pteridine  29.31 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5066  MFS family transporter  22.48 
 
 
434 aa  64.7  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.714396  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03756  hypothetical protein  23.87 
 
 
435 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0956  hypothetical protein  27.4 
 
 
560 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1267  major facilitator superfamily permease  28.57 
 
 
541 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.633668  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32854  FBT family transporter: folate/pteridine  24.56 
 
 
547 aa  56.6  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1506  hypothetical protein  26.39 
 
 
564 aa  49.7  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0478439  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
419 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>