23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1987 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1987  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  606  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.128578  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0341  hypothetical protein  74.07 
 
 
304 aa  453  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.559517  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23411  hypothetical protein  67.8 
 
 
295 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1089  hypothetical protein  54.39 
 
 
297 aa  345  6e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.806964  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19641  hypothetical protein  53.66 
 
 
288 aa  328  7e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.820475  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16411  hypothetical protein  52.9 
 
 
299 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0826  hypothetical protein  51.97 
 
 
311 aa  301  9e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16971  hypothetical protein  47.12 
 
 
301 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.752215  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1609  hypothetical protein  46.78 
 
 
302 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.203546  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17091  hypothetical protein  46.44 
 
 
302 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0647106  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17211  hypothetical protein  45.42 
 
 
302 aa  285  9e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0743  hypothetical protein  47.37 
 
 
309 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3395  hypothetical protein  47.29 
 
 
312 aa  261  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.561584  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0869  hypothetical protein  46.05 
 
 
310 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4482  hypothetical protein  44.37 
 
 
313 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.649328  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4418  hypothetical protein  44.37 
 
 
313 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2652  hypothetical protein  42.67 
 
 
312 aa  251  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.511542  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2711  hypothetical protein  34.22 
 
 
311 aa  205  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  0.20088 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4610  hypothetical protein  33.19 
 
 
306 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180993  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0337  hypothetical protein  30.77 
 
 
413 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00896127  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0007  hypothetical protein  30.07 
 
 
480 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2929  hypothetical protein  27.56 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  32.71 
 
 
277 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>