23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_A0007 on replicon NC_007411
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007411  Ava_A0007  hypothetical protein  100 
 
 
480 aa  981    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0337  hypothetical protein  43.73 
 
 
413 aa  245  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00896127  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2929  hypothetical protein  44.09 
 
 
395 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2652  hypothetical protein  35.43 
 
 
312 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.511542  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4482  hypothetical protein  32.38 
 
 
313 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.649328  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4418  hypothetical protein  32.38 
 
 
313 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0869  hypothetical protein  35.51 
 
 
310 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3395  hypothetical protein  34.65 
 
 
312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.561584  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0341  hypothetical protein  28.04 
 
 
304 aa  124  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.559517  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23411  hypothetical protein  29.97 
 
 
295 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1987  hypothetical protein  30.07 
 
 
297 aa  121  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.128578  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16971  hypothetical protein  33.07 
 
 
301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.752215  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0743  hypothetical protein  32.48 
 
 
309 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16411  hypothetical protein  30.17 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0826  hypothetical protein  31.35 
 
 
311 aa  106  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17091  hypothetical protein  27.85 
 
 
302 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0647106  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17211  hypothetical protein  27.24 
 
 
302 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1609  hypothetical protein  27.55 
 
 
302 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.203546  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2711  hypothetical protein  28.34 
 
 
311 aa  86.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  0.20088 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1089  hypothetical protein  29.11 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.806964  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19641  hypothetical protein  28.57 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.820475  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4610  hypothetical protein  25.1 
 
 
306 aa  61.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.180993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  30.11 
 
 
323 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>