22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1910 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1910  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  419  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0419  hypothetical protein  72.73 
 
 
208 aa  304  5.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0631886  normal  0.0277692 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0800  hypothetical protein  37.37 
 
 
197 aa  124  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0272  protein of unknown function DUF1001  34.69 
 
 
196 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1417  protein of unknown function DUF1001  35.71 
 
 
196 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.83474  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1383  protein of unknown function DUF1001  35.71 
 
 
196 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5043  hypothetical protein  35.71 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.968769  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3679  protein of unknown function DUF1001  34.17 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2275  hypothetical protein  36.67 
 
 
198 aa  114  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2579  hypothetical protein  34.05 
 
 
199 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.755501  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0440  CpeT-like  34.55 
 
 
204 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.566021  normal  0.637972 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03371  hypothetical protein  32.11 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22311  CpeT  31.82 
 
 
204 aa  92.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1887  CpeT-like  33.16 
 
 
204 aa  91.7  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0944089  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5722  protein of unknown function DUF1001  32.46 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0772  hypothetical protein  30.65 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.101942  normal  0.37279 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1676  CpeT protein  28.43 
 
 
199 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0329357  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03901  CpeT  28.06 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0448364  normal  0.0403253 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4526  protein of unknown function DUF1001  29.02 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.390851  normal  0.829315 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0979  hypothetical protein  27.32 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0600583  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5176  protein of unknown function DUF1001  25.46 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4579  hypothetical protein  24.37 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>