12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1697 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1697  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  520  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0319626  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07001  hypothetical protein  42.29 
 
 		 267 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0663  hypothetical protein  44.9 
 
 		 200 aa  99  7e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.545323 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2811  tetratricopeptide repeat-containing protein  27.75 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0556541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4498  Tetratricopeptide domain protein  24.39 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0431  Tetratricopeptide TPR_4  30.77 
 
 		 615 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.504045  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 466 aa  42.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2395  tetratricopeptide TPR_2  28.4 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 286 aa  42.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 		 286 aa  42.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  25.93 
 
 		 2679 aa  42.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 		 286 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>