18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1317 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1317  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  261  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1158  hypothetical protein  73.73 
 
 
124 aa  191  4e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.308257  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14501  Fe-S-cluster oxidoreductase  58.26 
 
 
124 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09121  Fe-S-cluster oxidoreductase  51.79 
 
 
121 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.598462  hitchhiker  0.00000874271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0589  Fe-S-cluster oxidoreductase-like  47.75 
 
 
220 aa  115  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0309459  normal  0.576133 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2303  hypothetical protein  49.09 
 
 
122 aa  113  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.798576  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2539  protein of unknown function UPF0153  44.95 
 
 
116 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3592  protein of unknown function UPF0153  44.55 
 
 
117 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2522  protein of unknown function UPF0153  44.55 
 
 
117 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.245259  normal  0.23939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2373  hypothetical protein  41.44 
 
 
116 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.960402  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3172  hypothetical protein  44.55 
 
 
116 aa  101  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4540  protein of unknown function UPF0153  41.82 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0950  hypothetical protein  39.09 
 
 
115 aa  96.7  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09261  Fe-S-cluster oxidoreductase  40 
 
 
115 aa  96.7  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10191  Fe-S-cluster oxidoreductase  41.12 
 
 
115 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10181  Fe-S-cluster oxidoreductase  40 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0834  hypothetical protein  38.46 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000035633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1958  hypothetical protein  33.77 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.781957  normal  0.865529 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>