25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3640 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3640  OmpA domain-containing protein  100 
 
 		 190 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.750133  normal  0.334713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3630  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  45.9 
 
 		 187 aa  170  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0787  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  52.07 
 
 		 167 aa  170  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3596  OmpA domain-containing protein  49.2 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.863386  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3151  OmpA domain-containing protein  51.48 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0816  OmpA domain-containing protein  51.48 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3810  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  48.68 
 
 		 187 aa  168  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3719  OmpA domain-containing protein  48.66 
 
 		 187 aa  168  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3527  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  48.66 
 
 		 187 aa  167  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000711222 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0823  OmpA domain-containing protein  47.89 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.961285  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0715  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  47.59 
 
 		 187 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3437  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  40 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2552  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  34.22 
 
 		 186 aa  114  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000761  OmpA-like transmembrane domain protein  27.96 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04884  hypothetical protein  31.34 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  28.65 
 
 		 373 aa  52.4  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0698  hypothetical protein  28.65 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3816  OmpA domain-containing protein  26.16 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.549731  normal  0.0255224 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  28.65 
 
 		 372 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  28.65 
 
 		 372 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  28.65 
 
 		 373 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  31.74 
 
 		 369 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  28.81 
 
 		 368 aa  42  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  31.74 
 
 		 369 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  26.44 
 
 		 318 aa  41.2  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>