32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2025 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2025  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2516  methyltransferase  28.25 
 
 
230 aa  87  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.524649  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14461  hypothetical protein  29.09 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3219  hypothetical protein  32.64 
 
 
322 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1531  hypothetical protein  25.68 
 
 
265 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.842491  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1603  methyltransferase  27.93 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0961948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3746  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  21.61 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.521801 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1261  macrocin O-methyltransferase  24.46 
 
 
281 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4080  macrocin O-methyltransferase  24.46 
 
 
281 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.310855  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  29.65 
 
 
434 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  29.65 
 
 
434 aa  52.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0930  macrocin-O-methyltransferase  27.03 
 
 
281 aa  51.6  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1116  macrocin-O-methyltransferase  27.22 
 
 
281 aa  52  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1290  putative bacteriocin O-metyltransferase  28.1 
 
 
281 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.133264 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1103  O-methyltransferase  28.1 
 
 
281 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1109  O-methyltransferase  28.1 
 
 
281 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1328  bacteriocin O-metyltransferase, putative  27.45 
 
 
281 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4288  hypothetical protein  25.45 
 
 
282 aa  49.7  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1318  hypothetical protein  25.27 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.000000517485 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1366  putative bacteriocin O-metyltransferase  28.1 
 
 
281 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1291  macrocin-O-methyltransferase  21.15 
 
 
291 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1221  bacteriocin O-metyltransferase  28.1 
 
 
281 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1480  hypothetical protein  26.92 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213383  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5644  hypothetical protein  23.44 
 
 
324 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2351  macrocin-O-methyltransferase  24.58 
 
 
557 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1129  bacteriocin O-metyltransferase  27.45 
 
 
281 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2419  macrocin-O-methyltransferase  23.08 
 
 
277 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2468  hypothetical protein  25 
 
 
281 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2171  hypothetical protein  26.59 
 
 
213 aa  45.4  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4591  methyltransferase  23.87 
 
 
158 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0597  hypothetical protein  25.64 
 
 
218 aa  42  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3940  macrocin-O-methyltransferase  25.62 
 
 
301 aa  42  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.881995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>