19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0554 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0554  outer membrane efflux family protein, putative  100 
 
 		 449 aa  891    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4083  outer membrane efflux family protein, putative  75 
 
 		 443 aa  648    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0539  outer membrane efflux family protein, putative  65.39 
 
 		 448 aa  565  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3358  outer membrane efflux family protein, putative  60.83 
 
 		 426 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3793  outer membrane efflux protein  60.52 
 
 		 490 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3975  outer membrane efflux protein  60.78 
 
 		 495 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3343  outer membrane efflux protein  58.87 
 
 		 492 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3849  outer membrane efflux protein  58.13 
 
 		 495 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0516  outer membrane efflux family protein, putative  55.26 
 
 		 456 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0516  outer membrane efflux protein  55.38 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3515  outer membrane efflux protein  55.16 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0518  outer membrane efflux family protein, putative  54.24 
 
 		 452 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0476  outer membrane efflux family protein, putative  60.19 
 
 		 233 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0475  outer membrane efflux protein  63.09 
 
 		 232 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02032  outer membrane protein, probably efflux family  30.49 
 
 		 400 aa  129  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154608  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1426  efflux family outer membrane protein  30.61 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2869  putative lipoprotein  31.12 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1861  efflux family outer membrane protein  25.32 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  24.25 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>