21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0624 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0624  glycosyltransferase  100 
 
 
249 aa  525  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1469  glycosyl transferase family 2  30.27 
 
 
267 aa  141  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  29.55 
 
 
694 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26800  glycosyl transferase  28.44 
 
 
617 aa  123  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  31.58 
 
 
641 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0373  hypothetical protein  30.32 
 
 
685 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26830  hypothetical protein  26.89 
 
 
629 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1644  hypothetical protein  27.71 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.946306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0618  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
670 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.958983  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0881  family 2 glycosyl transferase  27.07 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1635  hypothetical protein  28.99 
 
 
650 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168505  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4580  hypothetical protein  28 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0634  hypothetical protein  28.57 
 
 
513 aa  70.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.135526 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0876  hypothetical protein  23.96 
 
 
671 aa  68.9  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.912844  normal  0.438141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1641  hypothetical protein  24.51 
 
 
640 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0594  putative glycosyl transferase  30.43 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0891  glycosyl transferase family 2  22.4 
 
 
257 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4970  bifunctional hypothetical protein/glycosyltransferase  22.96 
 
 
1176 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  23.41 
 
 
318 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0910  glycosyl transferase  24.64 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 
302 aa  43.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>