14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0205 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0205  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2967  hypothetical protein  54.01 
 
 
192 aa  191  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3398  putative cytoplasmic protein  58.5 
 
 
158 aa  187  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0942275  normal  0.667135 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2705  hypothetical protein  57.82 
 
 
158 aa  184  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0054  hypothetical protein  48.62 
 
 
193 aa  173  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3221  hypothetical protein  42.46 
 
 
194 aa  157  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4171  hypothetical protein  43.58 
 
 
196 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700055  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2032  hypothetical protein  33.5 
 
 
206 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1755  hypothetical protein  30.77 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1965  hypothetical protein  31.55 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0008  hypothetical protein  30.6 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05795  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0113  hypothetical protein  24.64 
 
 
234 aa  53.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3553  hypothetical protein  27.56 
 
 
209 aa  45.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>