52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5091 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5091  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.774813 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4903  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5395  transposase IS3/IS911 family protein  79.25 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  77.36 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  71.7 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  75.47 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  71.7 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  71.7 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  71.7 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  71.7 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  75.47 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  71.7 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  71.7 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  71.7 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  69.81 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  69.81 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  80 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  80 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  74.47 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  82.22 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1261  transposase IS3/IS911  70.83 
 
 		 53 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4724  transposase IS3/IS911  70.21 
 
 		 71 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240633  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  66.04 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3959  transposase IS3/IS911  72.34 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546667  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0835  transposase IS3/IS911  69.23 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.907814  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  62.26 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  62.26 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  62.26 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  58 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  58 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  58 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  58 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  77.5 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>