15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2054 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2054  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  357  4e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0592172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3730  hypothetical protein  82.63 
 
 		 182 aa  296  8e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0111  hypothetical protein  32.92 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3841  hypothetical protein  35 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10777  hypothetical protein  32.08 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5163  hypothetical protein  28.05 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1594  hypothetical protein  27.85 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2052  hypothetical protein  28.19 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4584  hypothetical protein  28.22 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4672  hypothetical protein  28.22 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4967  hypothetical protein  28.22 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.654324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5469  hypothetical protein  27.67 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5090  hypothetical protein  27.04 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5178  hypothetical protein  27.04 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10139  hypothetical protein  26.99 
 
 		 167 aa  42  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>