More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1280 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1280  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
285 aa  558  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.864147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 
308 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.33 
 
 
299 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1747  hypothetical protein  29.01 
 
 
289 aa  142  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1747  hypothetical protein  29.01 
 
 
289 aa  142  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.31 
 
 
274 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.09 
 
 
309 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  33.96 
 
 
280 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  32.16 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  29.52 
 
 
304 aa  136  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.05 
 
 
311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.08 
 
 
290 aa  133  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.6 
 
 
296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.88 
 
 
288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.77 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.08 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.32 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.08 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.25 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.24 
 
 
301 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02871  flagellar biosynthetic protein FlhG  34.09 
 
 
288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742055  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1863  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.23 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0949609  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.84 
 
 
343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00958  flagellar synthesis regulator FleN  30.8 
 
 
294 aa  125  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.275874  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06208  flagellar synthesis regulator FleN  30.8 
 
 
294 aa  125  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121136  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.92 
 
 
281 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3469  flagellar synthesis regulator FleN  29.01 
 
 
271 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2012  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 
271 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1486  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.69 
 
 
278 aa  122  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3668  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.42 
 
 
277 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0704909  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 
333 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0326  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.17 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3438  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.42 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.704285  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1562  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.42 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100295  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1978  flagellar synthesis regulator FleN  29.34 
 
 
274 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3031  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.29 
 
 
288 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2165  flagellar number regulator FleN  29.96 
 
 
279 aa  119  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2806  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.04 
 
 
276 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.992955  normal  0.186543 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.93 
 
 
270 aa  119  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3911  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.04 
 
 
277 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.79 
 
 
310 aa  118  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4342  flagellar number regulator FleN  30.04 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422536  normal  0.723195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.04 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.44123  normal  0.658899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3873  flagellar synthesis regulator FleN  31.82 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45640  flagellar synthesis regulator FleN  31.82 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555509  normal  0.237681 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0382  flagellar synthesis regulator FleN  28.62 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.928835  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0706  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.38 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2390  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.91 
 
 
273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0478  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.94 
 
 
277 aa  116  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.09 
 
 
370 aa  115  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2156  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.43 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.09 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0158  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.15 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.726569  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.05 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1655  ParA family protein  29.1 
 
 
313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000026019  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.42 
 
 
295 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.62 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.04 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1518  flagellar biosynthetic protein FlhG  26.91 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0524451  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2910  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3052  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.54 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2560  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.54 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.110554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1298  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.92 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.206017  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.92 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1198  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.74 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000520334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0871  ParA protein  27.55 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1358  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.92 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  0.103677 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3211  flagellar biosynthetic protein FlhG  31.18 
 
 
283 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.92 
 
 
293 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.483613  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1634  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.33 
 
 
293 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.63 
 
 
294 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0179  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.67 
 
 
287 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347298  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.38 
 
 
303 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292285  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03145  hypothetical protein  28.79 
 
 
295 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2291  flagellar biosynthesis protein FlhG (flagellar number regulator)  28.63 
 
 
296 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3050  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.33 
 
 
293 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905912  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002831  flagellar synthesis regulator FleN  28.41 
 
 
295 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000517997  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.27 
 
 
278 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.53 
 
 
291 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.2 
 
 
298 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  28.02 
 
 
295 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.23 
 
 
293 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0384925  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1382  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.62 
 
 
303 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0481328  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1248  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  30.23 
 
 
267 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0275  ATP-binding protein  24.54 
 
 
295 aa  103  3e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.41 
 
 
519 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1313  NifH/FrxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.24 
 
 
302 aa  103  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
283 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2698  flagellar biosynthesis like protein  32.39 
 
 
266 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.04 
 
 
294 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0777217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3849  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.89 
 
 
306 aa  99.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000469993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1300  flagellar synthesis regulator FleN, putative  29.79 
 
 
272 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49294  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3765  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.09 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0698  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.15 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.6397 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
301 aa  96.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1928  flagellar biosynthesis switch protein  29.53 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.965527 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1911  cell division ATPase MinD  29.96 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1800  flagellar synthesis regulator FleN, putative  29.02 
 
 
272 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000162806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>