More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38660 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3981  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.85 
 
 		 542 aa  764    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2819  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.4 
 
 		 543 aa  789    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.708717  normal  0.776174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38660  acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 		 548 aa  1117    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5086  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.03 
 
 		 552 aa  722    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.480357  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4366  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  71.4 
 
 		 542 aa  773    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128811  hitchhiker  0.00458691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1017  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.3 
 
 		 549 aa  733    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10686  acyl-CoA dehydrogenase fadE8  66.42 
 
 		 542 aa  738    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6703  acyl-CoA dehydrogenase  71.46 
 
 		 539 aa  765    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0369  acyl-CoA dehydrogenase-like  65.43 
 
 		 561 aa  655    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1003  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.16 
 
 		 551 aa  735    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2251  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  70.02 
 
 		 534 aa  750    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141599  normal  0.0458056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0975  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  67.16 
 
 		 551 aa  734    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315485  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6434  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  62.41 
 
 		 572 aa  687    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441597  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1782  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  71.88 
 
 		 543 aa  781    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.121975  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6225  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  72.86 
 
 		 529 aa  760    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0993  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  67.16 
 
 		 551 aa  734    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1269  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.6 
 
 		 551 aa  719    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1752  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.04 
 
 		 550 aa  631  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.907741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0523  acyl-CoA dehydrogenase-like  56.1 
 
 		 562 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5281  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  60.07 
 
 		 550 aa  604  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.656776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2353  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  59.85 
 
 		 557 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.04 
 
 		 542 aa  600  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.108739  normal  0.35349 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3582  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.56 
 
 		 563 aa  585  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2837  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  52.64 
 
 		 563 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.218018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4257  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.19 
 
 		 559 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.175294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2695  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  55.5 
 
 		 545 aa  569  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682945  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0592  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.21 
 
 		 555 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.03 
 
 		 559 aa  551  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1136  putative acyl-CoA dehydrogenase  53.04 
 
 		 549 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12450  putative acyl-CoA dehydrogenase  53.31 
 
 		 549 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.744649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4943  Acyl-CoA dehydrogenase-like  52.49 
 
 		 549 aa  545  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3764  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.04 
 
 		 549 aa  544  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.598594  normal  0.0554036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4426  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  56.31 
 
 		 542 aa  537  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.880642 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0640  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.78 
 
 		 559 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.749852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09290  acyl-CoA dehydrogenase  53.48 
 
 		 571 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.142361  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.31 
 
 		 550 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.303527  hitchhiker  0.00591476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4338  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  51.56 
 
 		 549 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.59 
 
 		 550 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.216664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4834  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.68 
 
 		 550 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.938262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2916  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.91 
 
 		 546 aa  522  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.8 
 
 		 559 aa  509  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.716167  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1847  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.72 
 
 		 550 aa  511  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440141  normal  0.493968 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00944  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  47.75 
 
 		 560 aa  498  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.874747  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3912  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.79 
 
 		 548 aa  500  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000271467  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2958  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.06 
 
 		 545 aa  495  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179146  hitchhiker  0.0000711281 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0215  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.92 
 
 		 559 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.389081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0227  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.74 
 
 		 559 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0410  Acyl-CoA dehydrogenase  48.92 
 
 		 559 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0193  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.83 
 
 		 559 aa  488  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0598  acyl-CoA dehydrogenase family protein  49.43 
 
 		 551 aa  484  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0562  acyl-CoA dehydrogenase family protein  49.24 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0173  Acyl-CoA dehydrogenase  48.01 
 
 		 561 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3763  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.28 
 
 		 561 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.75018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2564  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.28 
 
 		 579 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3817  acyl-CoA dehydrogenase  48.15 
 
 		 548 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3665  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.81 
 
 		 530 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0161  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  47.91 
 
 		 561 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2827  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  48.33 
 
 		 550 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952078  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0100  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.45 
 
 		 551 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2924  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.09 
 
 		 557 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0116  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.36 
 
 		 550 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1360  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.99 
 
 		 543 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165599  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2218  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.18 
 
 		 568 aa  460  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.192858  normal  0.322981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0204  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  47.37 
 
 		 553 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.09 
 
 		 551 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0131  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.26 
 
 		 550 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4717  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.18 
 
 		 541 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4431  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.18 
 
 		 541 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4747  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.18 
 
 		 541 aa  451  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04054  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.18 
 
 		 541 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3806  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.18 
 
 		 541 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3826  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.18 
 
 		 541 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5703  isovaleryl CoA dehydrogenase  47.18 
 
 		 541 aa  450  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0120  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.91 
 
 		 564 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2281  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.71 
 
 		 547 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2938  acyl-CoA dehydrogenase-like  46.53 
 
 		 550 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4724  isovaleryl CoA dehydrogenase (adaptive response to DNA-methylation damage)  53.22 
 
 		 547 aa  449  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0117  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.53 
 
 		 550 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04016  hypothetical protein  47.18 
 
 		 541 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4658  isovaleryl CoA dehydrogenase  46.99 
 
 		 541 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.61602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3639  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.8 
 
 		 553 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2252  acyl-CoA dehydrogenase-like  50.84 
 
 		 549 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1763  acyl-CoA dehydrogenase  46.72 
 
 		 547 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3316  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.62 
 
 		 553 aa  445  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3297  Acyl-CoA dehydrogenase  46.53 
 
 		 550 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.165535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0365  isovaleryl CoA dehydrogenase  46.18 
 
 		 540 aa  440  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1083  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.26 
 
 		 538 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0687  isovaleryl CoA dehydrogenase  46.41 
 
 		 547 aa  438  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2006  acyl-CoA dehydrogenase  48.16 
 
 		 546 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315966  normal  0.474092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  53.48 
 
 		 538 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839474  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3788  isovaleryl CoA dehydrogenase  46.21 
 
 		 547 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0107  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.45 
 
 		 550 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3643  isovaleryl CoA dehydrogenase  46.21 
 
 		 547 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0160  acyl-CoA dehydrogenase  46.06 
 
 		 546 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0117  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.08 
 
 		 550 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0440  isovaleryl CoA dehydrogenase  46.15 
 
 		 544 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000763646 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4655  isovaleryl CoA dehydrogenase  45.44 
 
 		 540 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3955  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.06 
 
 		 546 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2968  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.06 
 
 		 546 aa  432  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4029  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  46.06 
 
 		 546 aa  432  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>