14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33500 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33500  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  749    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.178585  normal  0.421552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0532  ABC-type Na+ efflux pump permease component  34.13 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00136958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0108  putative ABC transporter  28.31 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.850247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1946  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0731  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  25.42 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2601  putative ABC transporter permease  27.55 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30220  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  26.17 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.861624  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1451  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  23.48 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1730  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  20.83 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000352957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1273  ABC-type Na+ efflux pump permease component- like protein  22.31 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1178  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  26.16 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0911263  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0635  ABC transporter (permease) (Na+ exclusion)  25.13 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000153887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2365  hypothetical protein  20.61 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2410  hypothetical protein  20.61 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0745502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>