37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32910 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_32910  acetyltransferase  100 
 
 
154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0237  GCN5-related protein N-acetyltransferase  45.39 
 
 
163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6913  hypothetical protein  57.83 
 
 
87 aa  97.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.471471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2090  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0537656  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3323  acetyltransferase  34.83 
 
 
176 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1761  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
194 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  32.58 
 
 
176 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  32.58 
 
 
176 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  32.58 
 
 
176 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0026  GCN5-related N-acetyltransferase  24.16 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2360  GCN5-related N-acetyltransferase  31 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136825  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1715  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.45 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3814  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
177 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2016  GCN5-related N-acetyltransferase  35.85 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059884  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0940  GCN5-related N-acetyltransferase  24.32 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0933  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4646  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.0465376 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2424  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.67 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6479  GCN5-related N-acetyltransferase  33.88 
 
 
185 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6597  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
171 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25620  acetyltransferase  23.08 
 
 
154 aa  43.9  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2134  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  32.28 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2665  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 
177 aa  42.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0357871  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3158  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
203 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  29.23 
 
 
320 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003393  histone acetyltransferase HPA2  28.97 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2943  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.31 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136246  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1326  GCN5-related N-acetyltransferase  25.81 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160898  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1879  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.266157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 
166 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
166 aa  41.2  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.975468  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.14 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4442  GCN5-related N-acetyltransferase  34.51 
 
 
194 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.745259  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 
173 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0084  GCN5-related N-acetyltransferase  33.64 
 
 
159 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>