29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13830 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13830  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  167  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381398  normal  0.46801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1296  hypothetical protein  75.47 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0767  hypothetical protein  46.25 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1937  hypothetical protein  71.11 
 
 		 61 aa  64.7  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20896  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3183  hypothetical protein  59.62 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1190  hypothetical protein  55.56 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3797  hypothetical protein  46.05 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0871  hypothetical protein  41.43 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272894  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3420  hypothetical protein  45.12 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2357  hypothetical protein  56.25 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1804  hypothetical protein  46.03 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1677  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.989943  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0807  secreted protein  36.49 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0934  hypothetical protein  58.54 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.860281  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3440  hypothetical protein  45.1 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.110215  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1316  hypothetical protein  44.93 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2724  hypothetical protein  45.1 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3451  hypothetical protein  45.1 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.296406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3503  hypothetical protein  45.1 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138277  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3221  hypothetical protein  47.83 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0124684  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0980  hypothetical protein  48.08 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0299177  normal  0.0279283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2738  hypothetical protein  41.82 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3812  hypothetical protein  45.1 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.285278  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  58.14 
 
 		 486 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17500  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04280  hypothetical protein  46 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6840  secreted protein  48.84 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26160  hypothetical protein  36.73 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12366  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>