12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08130 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08130  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  324  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4593  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.15 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1943  nitrogen-fixing NifU-like  39.01 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  33.56 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  33.56 
 
 		 294 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  35.71 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3815  hypothetical protein  35.33 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473897  normal  0.0339082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2624  hypothetical protein  39.87 
 
 		 412 aa  50.8  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.541634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2413  NifU domain-containing protein  28.88 
 
 		 297 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0708227  normal  0.256977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2491  hypothetical protein  31.01 
 
 		 202 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.78 
 
 		 306 aa  45.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 		 286 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>