24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07280 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07280  hypothetical protein  100 
 
 		 980 aa  1968    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0886  hypothetical protein  83.08 
 
 		 955 aa  1502    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0484  hypothetical protein  39.19 
 
 		 1201 aa  525  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0181373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4735  hypothetical protein  40.31 
 
 		 1114 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000107106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0639  hypothetical protein  38.57 
 
 		 920 aa  514  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4299  hypothetical protein  39.68 
 
 		 1056 aa  514  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.511127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0140  AAA ATPase  27.47 
 
 		 823 aa  200  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1100  AAA ATPase  26.35 
 
 		 821 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8472  hypothetical protein  26.27 
 
 		 830 aa  183  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547779  normal  0.957952 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0477  ATPase  25.2 
 
 		 827 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3057  AAA ATPase  25.21 
 
 		 816 aa  169  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1445  hypothetical protein  25.31 
 
 		 819 aa  95.5  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.218302  normal  0.184359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0308  hypothetical protein  23.49 
 
 		 807 aa  88.6  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.287416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1167  hypothetical protein  25.53 
 
 		 826 aa  87.4  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3115  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.25 
 
 		 802 aa  87.8  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0575  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  27.48 
 
 		 802 aa  86.3  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2508  hypothetical protein  21.42 
 
 		 792 aa  70.5  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0860063 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0044  hypothetical protein  23.29 
 
 		 856 aa  64.7  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0231  hypothetical protein  21.51 
 
 		 846 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5541  hypothetical protein  23.68 
 
 		 832 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696223 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5943  hypothetical protein  23.68 
 
 		 832 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0794  hypothetical protein  22.71 
 
 		 805 aa  55.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5543  hypothetical protein  24.87 
 
 		 818 aa  47.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0178014 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4631  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1028 aa  45.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>