18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04550 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04550  dienelactone hydrolase-like enzyme  100 
 
 		 278 aa  548  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0809694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6559  dienelactone hydrolase-like protein  56.04 
 
 		 270 aa  269  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1155  hypothetical protein  45.56 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0655389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1138  hypothetical protein  45.56 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1165  hypothetical protein  45.56 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746782  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4940  hypothetical protein  44.4 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.204789  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0876  hypothetical protein  39.41 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1479  hypothetical protein  44.03 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909184 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13475  hypothetical protein  46.42 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000130156  hitchhiker  0.00071947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1179  dienelactone hydrolase  42.68 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.401039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1708  hypothetical protein  42.37 
 
 		 315 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6636  hypothetical protein  32.54 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  27.5 
 
 		 567 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0658  hypothetical protein  26.88 
 
 		 313 aa  45.8  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000360188  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  26.64 
 
 		 547 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  30.48 
 
 		 568 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  30.07 
 
 		 285 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  30.09 
 
 		 551 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>